茶树est-ssr的信息分析与标记建立

在1589条茶树est中，共发掘出了281个est-ssr，分布于246条est中，出现频率是17．68％，平均长度为33．06bp，平均分布频率是1，2．61kb。在茶树est-ssr中，二核苷酸重复是主要的重复类型，出现最多的重复基元类型是ag／ct重复。设计了19对ssr引物，在对引物、dntp、mgcl2的浓度及退火温度等参数进行测试后，建立了合适的pcr反应体系。以衍生绝大多数est-ssr的龙井43dna为模板，对引物进行了筛选，有16对引物显示扩增，可用率为84．2％；进一步在10个茶树品种中进行多态性测试，显现出多态性的引物占可扩增引物的62．5％。本文研究结果证明了根据茶树est建立ssr标记是有效、可行的。完成机构：[1]浙江大学原子核农业科学研究所,浙江杭州310029 [2]杭州市农业科学院,浙江杭州310024