issr和est-ssr标记在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种遗传多样性上的比较分析
发布时间:2024-05-02 点击:56
本研究利用issr和est-ssr标记对中国13个、日本4个与肯尼亚5个茶树品种的遗传多样性进行分析,重点比较了issr和est-ssr在多态性位点数、引物解析能力、多态性信息含量和标记系数等方面的差异。结果表明在位点检测能力上issr明显高于est-ssr,每条issr引物可检测的平均条带数(12.5)比每对est-ssr引物(3.1)高三倍。issr标记的rp值是est-ssr标记的6.3倍,其多态性信息含量(pic)和标记系数(mi)也明显高于est-ssr,这表明issr具较高的多态性位点检测能力和较高的标记效率。est-ssr揭示的nei基因多样性(h=0.28)高于issr(0.21),这种差异进而会影响到遗传距离和聚类分析的结果。在检测中国、日本和肯尼亚茶树品种的遗传差异上,两种标记表现出较一致的趋势,中国茶树品种在多态性位点数量、nei基因多样性、遗传距离上均大于日本和肯尼亚的茶树品种。研究还表明,由于est-ssr可检测到等位位点的变异,它比issr可以更准确地反映和揭示供试品种的遗传多样性水平。同时由于单个est-ssr标记检测到的位点数量较issr标记少,且特异性较强,谱带较易分辨,因此比issr标记更适用于对大量样本的分析。完成机构:[1]中国农业科学院茶叶研究所、国家茶树改良中心,杭州310008 [2]浙江大学茶叶研究所,杭州310029